P-04課題解決

NVIDIA Clara Parabricksは実際にどのようなゲノミクス研究で使われていますか?

NVIDIA公式ブログの記事によると、英国の大規模バイオバンクであるUK Biobank(50万人超の参加者から集めた遺伝子データや医療画像・診療記録を保有し、世界の2万5000人超の研究者が利用する研究基盤)は、Regeneron Genetics Centerが実施したエクソーム(タンパク質コード領域)シーケンシングのデータ解析にNVIDIA Clara Parabricksを活用しました。この取り組みにより1200万件のコーディング領域の変異と、肝疾患・眼疾患・糖尿病・喘息リスクなどに関連する多数の遺伝子が特定されたとされています。記事では、32仮想CPUのマシンで約1時間かかっていたエクソーム全体の解析がClara Parabricksによって5分未満に短縮され、コストも約40%削減されたと報告されており、UK Biobankはクラウド型のResearch Analysis Platform上で6ヶ月間の無償利用枠を提供することで、低所得国の研究者を含む幅広い層へのアクセスを広げたとされています。

実績・根拠

情報ソース